《女头人》的女头人故事背景设定在怒江大峡谷中，这里云雾缭绕、女头人景色壮丽。女头人18年前的女头人一个月黑风高的夜晚，土匪头子山豹爷洗劫了傈僳族人的女头人栖息地——傈僳山寨，并在激烈的女头人战斗中杀害了傈僳族头人墨觉长老。长老临终前留下了一个秘密：一枚象征着傈僳族权力的女头人米斯牛头印章至今下落不明。为了弥补这个遗憾，女头人长老曾承诺在娜斯雨18岁生日时将头人的女头人位置交给她。十八年后，女头人当娜斯雨出落成一个美丽的女头人大姑娘之际，按照长老生前的女头人诺言，她的女头人身份即将被确认。然而，女头人米斯牛头印章仍没有出现，女头人这让临时长老夏帕普感到非常焦急。就在这关键时刻，李峡谷——墨觉长老当年酒盟的好友李南雄的儿子——带着藏了十八年的盒子来到了傈僳山寨。李峡谷的到来引起了一阵波澜，他不仅与娜斯雨产生了感情，还为找回印章而展开行动。随着两人深入月亮山洞寻找印章，秘密也被匿居山林的土匪头目山豹爷得知。在一番智斗之后，娜斯雨和李峡谷不仅成功夺回了印章，还摧毁了山豹爷的老巢。最终，在族人的拥戴下，娜斯雨成长为一位勇敢的新任傈僳族头人，而李峡谷则悄然离开，留下一个未解之谜，让观众心中久久难以平息。